研究院设立二级管理架构，减少行政层级，提高运行与工作效率。研究院组织架构如下图。

研究院设研究院工作指导委员会、院长办公室、专家委员会：

(1)研究院工作指导委员会：由校领导、校相关部门负责人组成，监督研究院运营符合校相关制度，评估体制机制创新效果。

(2)研究院管理班子：开展研究院的运营管理工作，设院长1人、副院长1人，下设办公室，配备工作人员2人。

(3)专家委员会：由校内外相关领域专家、教授、校领导担任校内专家，邀请兄弟院校相关教授、行业资深专家作为顾问。各学院设专家委员会常驻人员，以及预设浮动名额。主要负责制定研究院战略布局和发展方向、组织队伍申请、承担、评审各类科研项目、联络对接产业联盟。